菌种鉴定

菌种鉴定

屿创科技拥有经验丰富的经验，我们会协助您量身订制科研计划，更短的周期，更优惠的价格为您的科研之路保驾护航。

方案展示：真菌ITS测序

通过真菌通用引物进行鉴定，引物采用ITS.

方法：

1.基因组DNA 提取

2.PCR扩增：

3.序列信息：

4. NCBI：Blast比对

与NCBI数据库中BLAST序列比对，其结果与XX菌同源性100%， 其比对结果如下（序列部分展示）

Query  15    GTATAAACAACTTTGTACTGTGAAACTGCGAATGGCTCATTAAATCAGTTATAGTTTATT  74

             |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||

Sbjct  5     GTAT-AACAACTTTGTACTGTGAAACTGCGAATGGCTCATTAAATCAGTTATAGTTTATT  63

Query  75    TGATTATACCTTACTACTTGGATAACCGTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGCTAAAAAT  134

             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||

Sbjct  64    TGATTATACCTTACTACTTGGATAACCGTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGCTAAAAAT  123

Query  135   CCCGACTTCTGGAAGGGATGTATTTATTAGATAAAAAACCAACGCGGGCAACCGCTTGTT  194

             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||

Sbjct  124   CCCGACTTCTGGAAGGGATGTATTTATTAGATAAAAAACCAACGCGGGCAACCGCTTGTT  183

Query  195   TGGTGATTCATAATAACTTTTCGAATCGCATGGCCTTGTGCTGGCGATGTTTCATTCAAA  254

             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||

Sbjct  184   TGGTGATTCATAATAACTTTTCGAATCGCATGGCCTTGTGCTGGCGATGTTTCATTCAAA  243

Query  255   TTTCTGCCCTATCAACTTTCGATGGTAGGATAGAGGCCTACCATGGTTTTAACGGGTAAC  314

             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||

Sbjct  244   TTTCTGCCCTATCAACTTTCGATGGTAGGATAGAGGCCTACCATGGTTTTAACGGGTAAC  303

Query  315   GGGGAATTAGGGTTCGATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAACGGCTACCACATCCAAGGAA  374

             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||

Sbjct  304   GGGGAATTAGGGTTCGATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAACGGCTACCACATCCAAGGAA  363

Query  375   GGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCCGATACGGGGAGGTAGTGACAATAAATAACAA  434

             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||

Sbjct  364   GGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCCGATACGGGGAGGTAGTGACAATAAATAACAA  423

Query  435   TACAGGGCTTTTCAGTCTTGTAATTGGAATGAGTACAATTTAAATCTCTTAACGAGGAAC  494

             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||

Sbjct  424   TACAGGGCTTTTCAGTCTTGTAATTGGAATGAGTACAATTTAAATCTCTTAACGAGGAAC  483

Query  495   AATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATT  554

             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||

Sbjct  484   AATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATT  543

Query  555   AAAGTTGTTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGAATTTTAGGCCCGGTTGGACGGTCTGCCT  614

             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||

Sbjct  544   AAAGTTGTTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGAATTTTAGGCCCGGTTGGACGGTCTGCCT  603